Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD4BQ9Y2L6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD4BQ9Y2L6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD4BQ9Y2L6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD4BQ9Y2L6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD4BQ9Y2L6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD4BQ9Y2L6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD4BQ9Y2L6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMD4BQ9Y2L6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms