Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18L2Q9UHA2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms