Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT172Q9UG01 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms