Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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