Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms