Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms