Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD2Q9NZN4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD2Q9NZN4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms