Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C1orf109Q9NX04 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C1orf109Q9NX04 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms