Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT84Q9NSB2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms