Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM8Q9BZR9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms