Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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