Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP8Q9BV40 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms