Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AGMATQ9BSE5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AGMATQ9BSE5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms