Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EYA3Q99504 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA3Q99504 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms