Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CICQ96RK0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms