Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARXQ96QS3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARXQ96QS3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms