Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNDC3BQ96NL0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC3BQ96NL0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms