Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF4

CCDC140, Coiled-coil domain-containing protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC140Q96MF4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC140Q96MF4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC140Q96MF4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms