Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms