Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SENP8Q96LD8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms