Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALPK3Q96L96 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALPK3Q96L96 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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