Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEURL4Q96JN8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEURL4Q96JN8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms