Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA4DQ92854 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4DQ92854 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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