Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIFAP3Q92845 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms