Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PIK3C3Q8NEB9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PIK3C3Q8NEB9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms