Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RDH13Q8NBN7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms