Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD4Q7Z3J3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD4Q7Z3J3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD4Q7Z3J3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD4Q7Z3J3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD4Q7Z3J3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD4Q7Z3J3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms