Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP43Q70EL4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP43Q70EL4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms