Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms