Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf54Q6UWD8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms