Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCAPH2Q6IBW4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms