Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLX4IPQ5VYV7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms