Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms