Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEX3CQ5U5Q3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEX3CQ5U5Q3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms