Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDGFL1Q5TGJ6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDGFL1Q5TGJ6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms