Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5B0

LCE3E, Late cornified envelope protein 3E, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3EQ5T5B0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LCE3EQ5T5B0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms