Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4orf17Q53FE4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms