Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC38Q502W7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms