Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP28Q4G0W2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms