Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPEL1Q2QD12 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms