Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNCBQ16143 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNCBQ16143 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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