Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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VAMP3Q15836 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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VAMP3Q15836 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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VAMP3Q15836 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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VAMP3Q15836 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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VAMP3Q15836 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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VAMP3Q15836 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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VAMP3Q15836 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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