Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERC3Q15034 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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