Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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