Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB39AQ14964 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB39AQ14964 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms