Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HNF4GQ14541 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms