Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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ERV3-1Q14264 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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ERV3-1Q14264 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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ERV3-1Q14264 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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ERV3-1Q14264 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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ERV3-1Q14264 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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ERV3-1Q14264 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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ERV3-1Q14264 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ERV3-1Q14264 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ERV3-1Q14264 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ERV3-1Q14264 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ERV3-1Q14264 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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