Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SCARB2Q14108 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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