Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDK13Q14004 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK13Q14004 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
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