Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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